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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.18g210300

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm18
Start:49881202
stop:49896136
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.18g210300
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT3G08850.1AT ATRAPTOR1B,RAPTOR1,RAPTOR1B JGI N/AIEA
GO:0031929GO-bp TOR signaling JGI N/AIEA
GO:0031931GO-cc TORC1 complex JGI N/AIEA
GO:0005515GO-mf protein binding JGI N/AIEA
K07204KEGG Membrane trafficking JGI N/AIEA
PTHR12848PantherFam REGULATORY-ASSOCIATED PROTEIN OF MTOR JGI N/AIEA
PTHR12848:SF16PantherFam REGULATORY-ASSOCIATED PROTEIN OF MTOR JGI N/AIEA
PF00400Pfam WD domain, G-beta repeat JGI N/AIEA
PF14538Pfam Raptor N-terminal CASPase like domain JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.18g210300 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma18g44210 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.18g210300
>Glyma.18g210300.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g210300.1.p locus=Glyma.18g210300 id=Glyma.18g210300.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.18g210300.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g210300.2.p locus=Glyma.18g210300 id=Glyma.18g210300.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGAAGACTGGATGTGTAGCTCTAGTATTATGTTTAAACATTAGTGTCGATCCTCCAGATGTAATAAAGATATCCCCTTGTGCCAGAATGGAGTGCTGGATAGATCCTTTTTCTATGGCACCACAAAAGGCATTGGAGTCAATTGGAAAAACTTTGAGCAGTCAGTATGAAAGATGGCAACCAAAGGCCCGCTATAAATGTCAACTTGATCCGACAGTGGATGAGGTGAAGAAGCTTTGTACTACTTGTCGTAAATATGCAAAGTCGGAAAGAGTTTTATTCCATTACAATGGGCATGGTGTGCCAAAACCAACTGCTAATGGTGAAATTTGGGTCTTCAATAAGAGTTATACACAGTATATTCCCTTACCTATCAGTGAACTTGATTCCTGGCTGAAGACCCCATCAATTTACGTCATTGATTGCTCTGCGGCTGGGATGATTGTGAATTTCTTCATTGAGCTTCATGAATGGAGTCCTTCCAACTCCTCTGTGTCCCAAAGGGATTGCATTCTGCTTGCAGCATGTGAAGCACATGAGACTTTGCCTCAGAGTGCAGAATTCCCAGCTGATGTGTTTACATCTTGCCTTACCACACCTATAAAGATGGCATTGCGATGGTTTTGTACTCGTTCATTACTTCGTGAATCACTTGTTAATTCACTTATAGACAAGATCCCTGGCCGTCCAAATGACCGAAAGACACTTCTGGGTGAATTGAATTGGATCTTTACAGCAGTAACTGATACGATTGCCTGGAATGTTCTTCCTCATGATCTTTTTCAGAGACTGTTCAGACAGGATTTGCTTGTTGCAAGTCTGTTTCGAAATTTTCTACTTGCTGAGCGAATCATGCGATCTGCAAATTGTTCTCCTGTCTCTCACCCAATGTTACCTCCGACCCATCAGCATCATATGTGGGATGCATGGGACATGGCTGCTGAGCTCTGCCTCTCTCAACTTCCATCTTTAGTTGAGGATCCTAATTCTGAATTTCAGCGTAGTACATTTTTCACCGAGCAGTTGACAGCATTTGAGGTATGGCTTGACCATGGTTCTGAACATAAGAAACCACCAGAGCAGTTGCCTATAGTTCTTCAGGTTTTACATAGTCAATGCCATCGGTTTCGGGCTTTAGTACTCCTTGGAAGGTTCCTTGATATGGGGCCATGGGCTGTAGATCTGGCATTATCTGTTGGAATATTCCCATATGTTCTAAAGCTGTTACAAACAACAACACCAGAACTACGACAGATCCTTGTATTCATATGGACAAAGATTCTTGCACTTGATAAGTCATGTCAGGTTGATCTAGTGAAGGATGGTGGTCATATCTATTTTATTAAGTTTCTTGACAGCATGGAAGCATATCCAGAGCAACGCGCAATGGCTGCTTTTGTTTTGGCTGTGATTGTGGATGGTCATAGACGAGGCCAAGAAGCTTGTATTGAAGCTGGTTTGATTCATGTCTGCTTAAAGCATCTTCAGAGTTCATGTCCTAATGATTCACAAACTGAACCCCTTTTCCTTCAGTGGCTTTGCCTGTGTTTGGGGAAATTGTGGGAAGACTTTTCAGAGGCACAAACAATTGGTTTGCAGGAAGATGCCACTACTATATTTGCTCCTCTACTGTCTGAACCCCAGCCAGAGGTTAGGGCTTCTGCTGTTTTTGCACTAGGTACCATTCTTGATGTGGGATTTGATTCATGTAGAAGTGTTGGTGGAGATGAAGAATGTGATGATGATGATAAGTTTAGGGCTGAAGTTAGTATAGTTAAGAGTATGTTAGGTGTTGCTTCAGATGGTAGTCCATTGGTGAGGGCAGAGGTAGCAGTGGCTCTAGCACGATTTGCTTTTGGCCACAACAAGCACCTGAAATCTATTGCTGCTGCATATTGGAAGCCTCAAGCTAATTCTTTGATTAATTCCTTACCTTCATTGGCTAATATAAAAGGTTCGGTTGGTGGATATGCTAAACAGAACCAACACATGCCTTATGGAAGTATCGTTTCTCCTCAAATTGGTCCTATTAGGGTTGGAAATGACAATTCTCCAGTGATTCGAGATGGCCGCGTGTCTTCAAGCAGTCCTCTCGCTGGTTCAGGAATCATGCATGGATCCCCATTGTCTGATGATTCATCTCATCATTCTGATTCAGGAATTCTGAATGATGGTTTCAGCAATGGAGTGGTTAACCACACTGGACCAAAGCCCTTGGACAATGCATTGTATTCGCAATGTGTACTTGCTATGTGTACTTTAGCAAAGGATCCTTCTCCACGCATTGCAAATCTTGGTCGCCGGGTACTGTCCATAATAGGTATTGAACAAGTGGTTGCAAAACCATTGAAGTTTAGTGGTGTTCGGACTGCTGAATCTACAGCTTCTCCACTGGCTCGTTCATCTTCTTGGTTTGATATGAATGGAGGACACTTGCCACTGACCTTCAGAACTCCTCCAGTCAGTCCTCCTCGCCCAAGTTATATAACTCGAATGCGTAGAGTTTGTTCATTGGAGTTTAGGCCCCACCTGATGGATTCTCCTGACTCAGGATTAGCTGATCCACTCTTAGGTTCTGGTGGAGCTTCTGGGACTTCAGATCGAAGCTTTCTTCCACAATCAACTATATATAGTTGGAGTTGTGGGCACTTTTCCAAACCACTTTTAACTGCTGCAGATGATAGCGAAGAGGCATCAGCCAGAAGAGAAGAGAGGGAAAAATTTGCATTGGAGCACATAGGCAAATGCCAGCACTCTGCTGTTAGCAGGCTAATAAATCCAATTGCTAAATGGGACATAAAGGGTACACAAACAGCATTGCTGCAACCTTTCTCTCCTATAGTGATAGCTGCAGATGAGAATGAACGTATCAGGATATGGAACCATGAGGAGGCTACACTGCTTAACAGTTTTGATAATCATGATTTTCCCGACAAAGGAATTTCTAAGCTCTGCCTTGTAAATGAGCTTGATGATAGCTTGCTTCTTGCTGCTTCATCTGATGGAAACATTCGGATTTGGAAGGACTATACTCTTAAGGGTAAACAAAAACTTGTCACTGCATTCTCTTCAATTCATGGTCATAAACCTGGTGTGAGGAGTCTGAATGCAGTTGTTGATTGGCAACAACAATGTGGCTATCTGTATGCATCGGGTGAGATATCATCTATTATGCTATGGGATGTTGATAAAGAGCAGCTTGTTAATTCTAAATCTTCATCATCAGATTGCAGTGTCTCAGTGTTGGCAGCATCACAAGTTCATGGGGGACAATTTGCAGCTGGTTTCGTGGATGGTTCTGTTCGACTTTATGATGTCAGAACACCTGATATGCTCGTCTGTGGATTAAGGCCTCATACACAAAGAGTAGAAAAGGTTGTGGGGATTGGCTTTCAGCCTGGATTAGACCAAGGAAAGATTGTTAGCGCTTCCCAGGCTGGGGATATCCAATTTCTTGATATAAGAAATCATAGCAGTGCGTATCTTACTATTGAAGCTCATAGGGGTTCACTCACAGCTTTAGCGGTACATAGACATGCTCCAATTATTGCCAGTGGTTCAGCGAAACAATTCATTAAGGTCTTTAGTCTGGAGGGTGATCAACTAGGCACCATTAAATACTATCCTACCCTAATGGCCCAGAAAATTGGTTCTGTAAGCTGCCTCAATTTCCATCCATACCAAGTATTACTTGCTGCTGGTGCTGCAGATGCATGCGTTTGTATTTATGCTGATGACAACACTCAAGCAAGATGA

>Glyma.18g210300.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g210300.3.p locus=Glyma.18g210300 id=Glyma.18g210300.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.18g210300.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g210300.6.p locus=Glyma.18g210300 id=Glyma.18g210300.6.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.18g210300.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g210300.7.p locus=Glyma.18g210300 id=Glyma.18g210300.7.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.18g210300
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>Glyma.18g210300.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.18g210300.2 locus=Glyma.18g210300 id=Glyma.18g210300.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.18g210300.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.18g210300.3 locus=Glyma.18g210300 id=Glyma.18g210300.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.18g210300.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.18g210300.6 locus=Glyma.18g210300 id=Glyma.18g210300.6.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.18g210300.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.18g210300.7 locus=Glyma.18g210300 id=Glyma.18g210300.7.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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