SoyBase Follow us on Twitter @SoyBaseDatabase
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research



   
   
Element ID   RLG_Gmr213_Gm5-1
Reference   Du et al. 2010 BMC Genomics 2010, 11:113
Class   I
Subclass   I
Order   LTR
Super Family   Gypsy
Family   Gmr213
Description   INTACT
Chromosome   Gm05
Start Position   34930319
End Position   34935588
Sequence   TGAAATGATACAGAGAGTGATATAGAGAGCTAAGGAATTTTGGATTGAAACTAGTATCAACCTCTACAATTGTAGAGGGA
TTTGCAGTACAAGCTGTGAATACAGGGAAAGTTTTTGGGAGAGAGAAATTAGATTCACAATTCACACGATATTCTCTAAG
TACCCTTAGCTCTTCTATTTAACTACTCAAGAAGTAACGAAATCCTTCAATTGGTTGTTGGCCTTGCGTGCTCTGGTGCT
TTTGCGCATTCCCTGTAATTCCGGATCCTGCATAACAGAATTATCCTCTTGCATTCCATGTGGGCCCTTACACACTTGAA
TTGATGACTCAGCAACATCTATTTCCTTCTCCTTAATTTGTCTTATTACAATACCATCCCCATTTAAGACAACCTTGTCC
TCAAGGTTGAAGCTAGGATAATTGGCTTTCATATCTTCCAACCCTTCCCATGTGGATTCATCTGGTGGCATGTTTGTCCA
TTGGATAAGAACCTGTGGAATCTTCAACTCTCCTTGTTGAATCACACGTGCAGCTAGTACCTTAGCAGGTAGTACAATAG
GCCCAATATCAGTCATTGTCAAGGGAAGTGGCATGTATTGTTCAGTGGTCCCTCCTTTGAAGGGCTTCAATTGTGACACA
TGGAAAACTGAGTGAATCTTTGCTTCTTCTGGTAATTGGAGCTTGTAGGCTACAACACCTACCTTAGCTATTATCATGAA
AGGTCCAAAAAATCTCATACCCAATTTTTTTATTCTTTCTCAAAGCAACAGATTGCTGCCTATAAGGTTGTAATCGTACC
AGCACCCAATCTCCAACCTGCAGCTCAAGATCTCTCCTTTTCTTGTCAGCTTGATTTTTCATATAAACTTGTGCTCTTTC
CAAGTTACTTTTGAGCTGTTGTAGAGTTCTGTCTCTTTCTCCCAGCTGCTCTTGCACCGTAATAGGGTCATTTGGTTGAG
GCCTATAGCGAGTTAAAGCTGGAGGGTCCCTCCCATAGAGTGCTTTAAAGGGTGTCATGCCAATGCTTGTATGGTGAGCT
GTATTGTACCAGTATTCAGCCCAAGTTAAAGCTTTATACCAAGCCTTAGGATTCTCAAAAGTGAAACATCTCAAAAACAT
CTCTAAACACTTGTTGAGAATTTCAGATTGTCCATCTGACTGTGGGTGATATGCAGAACTCATGGCCAATGTTGTACCCT
GTATCTCAAATAATCTTTTCCAGAAATCGCTAGTGAATACCTTGTCTCTGTCTGAAACTATAGACTTTGGAATTCCATGC
AACTTCACTATATAATTCATGAAAGCCTCTGCAACTGTTTTACTGCTGTAATCACTTTTAAGTGGAACAAAGTGAGCAAA
TTTTGTCAATCTATCAATTACCACCATTATTGTAGTGTAGCCAAAAGAGGGAGGTAGCCCAGTAATGAAATCCATAGCTA
CATCTTCCCATACCTGAGATGGGATGGGCAATGGTTGGAGCAACCCAGCTGGTAAACTATGAGAAGATTTTGCTTGCTGA
CATATAGCACAATTTTGCACAAACTGTTCGATGTCTTTCTTCATATTGTGCCAAAAATATTGATAAGCAATTCTAGCCAT
GGTTCTAGAATTTCCTGAATGTCCCCCAATAGGAGAGCTGTGATTCTCCTTCAAAATCATTTGAATCAAGTTAGAAGCGT
CTGGTATAACCAACCTGCCTTTCCAATAAAGCAGTCCCTCTTTGGTCGTGTAGTGAGGCTTCAGCTGGGGGTGATCTTTG
CATTGAGTTATGAGCTCCTGCATTTTATCATTACTCTTCACTTCATCTAGTAATTGTTGCATAAATCGTGTCTTTGGTTC
AGACCACGATATCATGAACATTCTGGACAAGGAATCGGCAGCTATGTTCGCCTTTCCTGGATTATACTCAATGACAAAAT
CGTAACCCAGAAACTTGTGTAGCCATTCTTGTTGTTCAGGTGTTTGTAGGCTTTGATCCATCAAGCTTCTCAAGCTCTTC
TGATCAGTCCTGATGATAAACTTACTCCCCAATAAGTAGTGCCTGAACTTTGCGATGGCTTCAGCTATAGCGAGCATTTC
TCTAAAGTAAGCTGATTTCTTCTGGTTTCGTGGTGCCAGCTTCTTTGAGAAAAATGCTATCGGGTGGCCATTTTGGTGCA
GAACTGCCCCCACTCCAATTCCTGAAGCGTCAGTTTCAAGGATAAAAGTTTGTTGGAAATTCGGCAGAGCTAATACAGGT
GCAGATGTGATGGCTTGTTGCAGCCCTTGAAAAGCTTCTTGTGTTGTTTCATTCCAGCAAAATGAATCTTTCCTTAACAA
GTCTGTTAAAGGAGCTGCTATTTTGGCATACGATTTAATGAATCGTCTATAGTAGCCGGTCAATCCTAAAAACCCTCTCA
ACTATTTCAGGTTAGGAGGTGTTGGCCACTTGAGAACTGCTTCAATCTTTGTTGCCTCCATTGCTACCCCTTTCCCTGAC
ACCACATGTCCCAGATACTCTATCTCCTCAACCCCAAAAACACATTTTGATAGTTTTACATACAGGGTATTTTGTTCTAA
CACCTGTAAAACTGCTTCCAAATGTGTGAGGTGGTCCTTCCAAGTGGTACTATACACAAGGATGTCATCAAAAAATACCA
ATACATACTTCCTCAGAGCATGTTGAACAATTTGATTCATGAGACATTGGAAGGTTGCTGGCGCGTTTGTTAACCCAAAT
GGCATAACTAGCCATTCATAATGACCATGGTGGGTCCTAAAAGCAGTCTTGTGTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACAA
CTCATCTACAGTAGGCATAGGGAAACTATCCTTAACTGTAATGGCATTTAAAGCTCTATAGTCTGTGCAAAACCTCCAAC
TTCCATCTTTCTTTTTCACTAACACAATGGGAGATGAAAAAGGGCTATTACTGGGCTGAATGATTCCTTGATCTAGCATC
TCTTTCACCATCTTTTCAATTTGCTCCTTTTGACTGTGGGGATACCTATAAGGTTTAACTTTGACCGGATTGGAGCCCTC
TTTCAAAGGAATAGCATGGTTTTGAGGTCTTTGGGGTGGTAGTCCTTCTGGTGTCTTGAAAATACCTCTGTAAGTATATA
ATATCACAGCCACCTCAGGTGACATGTTAGCTGGTATCTCATCCCATACGTCATTGACTGCATCAGCTTGTACTCTCTCT
ACAGTGAACACTTCATCAATACTTCTAGTGTTACACATCCTTTTCAGCTGATGTAATTGTGCCTGACCTGGTCCCATGCT
TGTGTCACCCTGTAATGTAATGAATTTTCCTTTGTGGAAAAATTTCAAAGTTAAAGCTGAATAGTCTGCCACATGAGGCC
CTAAAGTAGCCAACCAAGCTGTCCCCAATATTAAGTCTGCACCAGCTACAGGTAAAAGGTACACAGGAATCAACATTTCA
TGCTCTTGAATGACTACAGGGAGTTGTGTCACTACCCCCTCTGCTGTCATAGTCTGTCCATTTCCCACTAACACCTTAAA
GCAGGGTGCTGGTTCCACTGGTAATTTCAGAAAATGCGCAATTCTTGGTTGTACAAAATTATCAGAGCTCCCTCCATCAA
TAAGTATTTGTACTTGGAGTTTGCCAATTTTCCCCATGAAACGCATTGTCCCTAGACTGTTGGCTCCTTTCATTGCATTC
AAGGATAGGTGATGTTCTGTGTGAGTTTGGTTTATGATGTTTTGTGGTTGGTCTGGTGGTTCTGTTTCCTCTTCTGCTGC
ATTTTCTGGTTCATGGTCAGATTGCAACAACATCAGGTGTTTGTTAGGACACTTGTGGCTAAATGAGAATTTCTCATCGC
ACCAATAACACAGTCCTTTGTCCTTCCTTAATTGCATCTCTGCAGGGGTGATTCTTTTGATATTTGGATTCTTTTGGTTA
ATGTCCATGGGTCTGGTAGGGGGTGTTGGTAATAAGGGAGTATTGGTTGGTTTTTGGTTGATTTCTGGTTTATTTGAATT
GAAGTGAGCTCTATTTTGGTATTGAGTGTTTGGGTTTTGGTATTTTTGTGGTTTGGTGTTGGAAGTGTATTTTTCTTCAT
AAACTTTTGCTAGGGACACAGCTTTCACAATGTTAATAGGAGTGTGAATCATCACATCTCTCCTAATATCGGGGTTTAAG
CCACTTATAAAACAATCAACAAGAGCATCAGTGCTTAATCCATAGACCCTGTTTGCTAAAGCAGTAAATTGCCGATAATA
ATCACTCACAGTCCCAGTTTGGCTAAGCTTAAACAAGGTAGCTCTAGGACAATCATAGATTGAAGGTCCAAAATCCAGTT
CTAAGGCACGAGTGAACTCAGCCCAGGAATTAAAAGGATGTGTTCTCTGTATCATTTGAAACCAAGGTACCACATCTTGA
TCAAGATGAACAGATGTGATAGTCAATCGATCCTTATCAGGGGTTTCATAATAATCGAAAAATTGCTCAGCTCTAAAAAT
CCATTCCATTACATTTTTGCCATCAAAACGGGGGAAATCGAGCTTGACATTTCTTACCTGAAACGGAGCTTTGTTTGAGT
TCGTAACACCATGGGAAGAGGTCTGAGAGGAGTTGCGTAATAACATCGAAAGAGCTTCGTTGATTTTATCCAGTTTCCCA
TCAGTGGACGATTGCAGATCCTCCATGGTTTGAAATCGAGCATCCGTCACAGCACCAAAACGCTCAAACTGGATCTGAAC
TTCATCGTACAACTTCTTGATATCGTCGGCGTTTTTCTTCACGTCGGTGGCGAGCTCTTTCATTCTGGTGTTGTCTGCCA
TGGTGAGATGAAAGCACCAATGAAATGATACAGAGAGTGATATAGAGAGCTAAGGAATTTTGGATTGAAACTAGTATCAA
CCTCTACAATTGTAGAGGGATTTGCAGTACAAGCTGTGAATACAGGGAAAGTTTTTGGGAGAGAGAAATTAGATTCACAA
TTCACACGATATTCTCTAAGTACCCTTAGCTCTTCTATTTAACTACTCAAGAAGTAACGAAATCCTTCAATTGGTTGTTG
GCCTTGCGTGCTCTGGTGCTTTTGCGCATTCCCTGTAATTCCGGATCCTGCATAACAGAATTATCCTCTTGCATTCCATG
TGGGCCCTTACACACTTGAATTGATGACTCAGCAACATCTATTTCCTTCTCCTTAATTTGTCTTATTACA





Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
USDA Logo
Iowa State University Logo